福州大学软件工程专业起步于1977年的软件专业和计算机技术专业，2012年获批“软件工程”一级学科硕士学位授予点，福州大学“工程”和“计算机科学”学科均位列esi全球排名前1%。本学科立足学科前沿，围绕服务国家和地方经济社会发展需求，组建特色学科平台与学科团队、凝练特色学科方向、发挥特色学科优势，在提高服务社会贡献率方面持续进行探索与实践，取得了较大成效，为福建省经济社会发展和“数字福建”战略做出了巨大贡献。
本学科已形成数据挖掘、智能信息处理、网络信息安全、网络与分布式系统等四个特色优势学科方向，拥有福建省大数据应用技术重大研发平台、福建省新媒体行业技术开发基地、福建省智慧地铁高校重点实验室等4个省级科研平台，以及网络安全与计算机技术虚拟仿真福建省实验教学示范中心等2个省级实验教学示范中心。本学科拥有一支为数50人的师德优良、学术水平高、梯队结构合理、符合要求的专职和兼职教师队伍，近5年，本学科师生聚焦国家和福建省重大需求开展科学研究，主持各类项目50余项，发表sci论文100篇，其中，在中科院1区期刊上发表论文20余篇，产出一批重要的研究成果，获得省部级一等奖1、二等奖1项、三等奖4项。
本学科以培养德智体美劳全面发展的社会主义建设者和接班人为目标，努力提升人才培养质量。通过扩大宣传力度和制定激励政策来确保生源质量，本学科录取的硕士研究生50%来自于985或211学校。本学科高度重视研究生培养过程，为研究生设置结构合理的课程体系,以“课赛结合”为抓手强化课程实践；在严格的研究生导师遴选、考核基础上，以导师团队指导的方式，提升研究生培养质量。本学科在国内外学科竞赛中取得优异成绩，其中，集成电路辅助设计团队连续三年获得iccad竞赛全球第一名，超算团队连续两年获得asc全球总决赛一等奖，acm团队先后九次晋级acm全球总决赛（2018年全球第14名）。